土壤有機質是土壤中各類營養元素，特別是N、P的重要來源。也是土壤微生物必不可少的碳源和能源，它影響著土壤的理化性質。因此，土壤有機質質量分數的高低，是衡量土壤肥力水平的重要標志之一。土壤有機質分為三大類：第一類是分解很少，仍保持原形態特征的動植物殘體；第二類是植物殘體的半分解產物及微生物代謝產物；第三類是有機質的分解與合成從而形成較穩定的高分子化合物-腐殖酸類物質。在分析測定土壤有機質質量分數時，實際包括了上述的第二類、第三類和第一類的一部分，以此來說明土壤肥力特性是合適的。因此，在作土壤有機質樣品前處理的時候，應將未分解的植物根系挑揀出來，以免影響數據分析。

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